Xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định: Những rủi ro doanh nghiệp cần tránh

Việc tạm ngừng hoạt động kinh doanh là quyền của doanh nghiệp theo Luật Doanh nghiệp. Tuy nhiên, không ít doanh nghiệp chủ quan, thực hiện sai quy định dẫn đến vi phạm nghĩa vụ thuế và bị xử phạt. Các lỗi phổ biến bao gồm: không thông báo đúng thời hạn, hoạt động lại mà không khai báo, không nộp tờ khai trong thời gian tạm ngừng,…

Bài viết sau sẽ giúp bạn hiểu rõ các hình thức xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định, mức tiền phạt theo từng lỗi cụ thể và cách phòng tránh. Công ty TNHH TM-DV Pháp Lý Gia Minh sẽ đồng hành cùng bạn đảm bảo việc tạm ngừng hợp pháp – không rủi ro – không phát sinh phạt thuế.

1. Quy định pháp luật về tạm ngừng kinh doanh và thuế

1.1. Luật điều chỉnh và cơ quan quản lý thuế liên quan

Việc tạm ngừng hoạt động kinh doanh là quyền hợp pháp của doanh nghiệp, được ghi nhận tại Điều 206 Luật Doanh nghiệp 2020. Tuy nhiên, đi kèm với quyền đó là trách nhiệm thực hiện đầy đủ thủ tục pháp lý và nghĩa vụ thuế trong thời gian tạm ngừng.

Những văn bản pháp lý chính liên quan bao gồm:

• Luật Quản lý thuế 2019: quy định trách nhiệm nộp tờ khai, thuế dù doanh nghiệp tạm ngừng.
• Luật Doanh nghiệp 2020: quy định thủ tục tạm ngừng và hoạt động trở lại.
• Nghị định 01/2021/NĐ-CP: hướng dẫn chi tiết đăng ký doanh nghiệp, mẫu thông báo tạm ngừng/hoạt động lại (Mẫu II-21).
• Nghị định 126/2020/NĐ-CP và Nghị định 91/2022/NĐ-CP: hướng dẫn xử lý vi phạm hành chính về thuế khi doanh nghiệp không khai báo đúng thời hạn.

Cơ quan thuế có quyền giám sát trạng thái hoạt động kinh doanh thông qua hệ thống mã số thuế và kê khai định kỳ. Bất kỳ sai phạm nào trong việc khai báo tạm ngừng hoặc quay lại hoạt động đều có thể dẫn đến xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định.

1.2. Nghĩa vụ thuế khi tạm ngừng – không thể bỏ qua

Nhiều doanh nghiệp hiểu lầm rằng tạm ngừng là “được miễn mọi nghĩa vụ”, nhưng thực tế thì hoàn toàn ngược lại. Khi tạm ngừng hợp pháp, doanh nghiệp vẫn cần tuân thủ các nghĩa vụ thuế quan trọng sau:

• Nộp tờ khai thuế môn bài nếu thời điểm hoạt động lại thuộc trong năm tài chính.
• Nộp tờ khai VAT, TNDN, TNCN theo đúng kỳ kê khai, kể cả khai “trắng” nếu không phát sinh.
• Không được phát hành hóa đơn trong thời gian tạm ngừng.
• Thông báo bằng văn bản cho cơ quan thuế và nhận xác nhận trạng thái “ngừng hoạt động”.

Việc không thực hiện đúng những nghĩa vụ trên có thể khiến doanh nghiệp bị xử lý hành chính và phải nộp phạt vi phạm thuế theo quy định. Đây là lỗi phổ biến dẫn đến xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định mà nhiều doanh nghiệp nhỏ mắc phải.

2. Các hành vi vi phạm thường gặp khi tạm ngừng kinh doanh

2.1. Không nộp thông báo tạm ngừng đúng thời hạn

Doanh nghiệp muốn tạm ngừng hoạt động bắt buộc phải thông báo bằng văn bản đến Sở KH&ĐT tối thiểu 03 ngày làm việc trước ngày tạm ngừng theo Điều 206 Luật Doanh nghiệp 2020.

Nếu không thực hiện đúng thời hạn hoặc không nộp thông báo, doanh nghiệp sẽ bị xem là vẫn đang hoạt động và phải nộp đầy đủ tờ khai, lệ phí theo quy định. Trong trường hợp bị phát hiện, doanh nghiệp sẽ bị xử phạt từ 5 đến 10 triệu đồng tùy mức độ vi phạm theo Nghị định 122/2021/NĐ-CP.

Đây là lỗi rất phổ biến dẫn đến xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định, đặc biệt ở các doanh nghiệp nhỏ, startup, hoặc đơn vị tạm ngừng không có nhân sự theo dõi hồ sơ thuế.

2.2. Tạm ngừng nhưng vẫn phát sinh giao dịch

Khi doanh nghiệp đã thông báo tạm ngừng, mọi hoạt động kinh doanh, phát hành hóa đơn, ký kết hợp đồng, sử dụng tài khoản ngân hàng… đều bị giới hạn. Tuy nhiên, thực tế có nhiều trường hợp:

• Tiếp tục giao dịch đầu vào – đầu ra
• Xuất hóa đơn điện tử khi hệ thống chưa kịp chặn
• Thu tiền từ khách hàng qua tài khoản công ty

Các hành vi trên bị xem là hoạt động kinh doanh không phép và sẽ bị xử phạt nghiêm trọng về thuế. Mức xử phạt có thể lên đến 50 triệu đồng tùy hành vi và hậu quả phát sinh (theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP).

2.3. Hoạt động lại mà không khai báo cơ quan thuế

Việc quay lại hoạt động kinh doanh sau tạm ngừng cần phải được thực hiện thông qua thủ tục tiếp tục kinh doanh với cả Sở KH&ĐT và cơ quan thuế. Tuy nhiên, nhiều doanh nghiệp chủ quan – hoạt động lại, ký hợp đồng, xuất hóa đơn,… mà không làm thủ tục thông báo hoạt động trở lại.

Khi bị cơ quan thuế phát hiện, doanh nghiệp có thể bị áp dụng đồng thời:

• Phạt hành chính từ 5–10 triệu đồng
• Buộc nộp lại toàn bộ tờ khai thuế và bị truy thu
• Đưa vào danh sách rủi ro cao – kiểm tra đặc biệt

Đây chính là lý do vì sao xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định thường bắt nguồn từ các hành vi tưởng chừng nhỏ nhưng gây hậu quả lớn.

Xem ngay: Thủ tục tạm ngừng kinh doanh để tránh vi phạm.

3. Mức xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định

3.1. Phạt hành chính về nghĩa vụ khai thuế

Khi doanh nghiệp tạm ngừng hoạt động hợp pháp, họ có thể được miễn nộp thuế nếu không phát sinh doanh thu. Tuy nhiên, nghĩa vụ kê khai thuế (nộp tờ khai trắng hoặc thông báo không phát sinh) vẫn bắt buộc thực hiện đúng kỳ.

Trường hợp không nộp tờ khai đúng hạn hoặc không khai báo, doanh nghiệp có thể bị xử phạt theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP như sau:

• Chậm nộp tờ khai thuế dưới 30 ngày: 1.000.000 – 3.000.000 VNĐ
• Chậm nộp từ 30–60 ngày: 3.000.000 – 5.000.000 VNĐ
• Trên 60 ngày hoặc không nộp: phạt đến 8.000.000 VNĐ + truy thu nghĩa vụ thuế (nếu có)

Đây là lỗi thường gặp nhất trong các trường hợp xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định, đặc biệt với doanh nghiệp nhỏ không có bộ phận kế toán theo dõi thường xuyên.

3.2. Phạt do không nộp tờ khai thuế môn bài

Khi doanh nghiệp quay lại hoạt động trong năm tài chính, họ bắt buộc phải nộp tờ khai thuế môn bài trong vòng 30 ngày. Nếu không thực hiện, sẽ bị xử phạt:

• Không nộp tờ khai môn bài: phạt từ 2.000.000 – 5.000.000 VNĐ
• Không nộp tiền thuế môn bài đúng hạn: bị tính tiền chậm nộp 0,03%/ngày

Đặc biệt, doanh nghiệp đã từng tạm ngừng mà không khai lại khi hoạt động, rất dễ quên nghĩa vụ này – và bị Chi cục Thuế kiểm tra đột xuất, truy thu kèm phạt.

3.3. Phạt khi sử dụng hóa đơn trái phép trong thời gian tạm ngừng

Trong thời gian tạm ngừng, doanh nghiệp không được phát hành, viết, ký hay gửi hóa đơn điện tử dưới bất kỳ hình thức nào. Nếu vẫn phát sinh hóa đơn hoặc kê khai doanh thu trong thời điểm này, sẽ bị xử lý theo:

• Điều 24 Nghị định 125/2020/NĐ-CP: Phạt 20.000.000 – 50.000.000 VNĐ với hành vi sử dụng hóa đơn không hợp lệ.
• Cưỡng chế ngừng phát hành hóa đơn hoặc treo mã số thuế

Đây là hình thức xử phạt nghiêm khắc, thường gặp ở các doanh nghiệp hoạt động “chui” trong thời gian tạm ngừng mà không báo cáo với cơ quan đăng ký kinh doanh.

Xem thêm: Tạm ngừng kinh doanh và đóng mã số thuế đúng quy định

4. Tình huống thực tế doanh nghiệp bị xử phạt thuế do tạm ngừng sai

4.1. Doanh nghiệp A hoạt động ngầm trong thời gian ngừng

Doanh nghiệp A tại Bình Dương nộp thông báo tạm ngừng kinh doanh từ tháng 01 đến tháng 06 năm 2025. Tuy nhiên, trong tháng 04 và 05, doanh nghiệp vẫn xuất 3 hóa đơn GTGT để giữ khách hàng. Sau khi cơ quan thuế rà soát dữ liệu hóa đơn, phát hiện thời điểm phát hành trùng với thời gian tạm ngừng.

Kết quả xử lý:

• Phạt 30 triệu đồng do sử dụng hóa đơn không hợp lệ
• Buộc khai bổ sung tờ khai VAT và nộp phạt chậm kê khai
• Kiểm tra truy thu toàn bộ doanh thu phát sinh trong thời điểm sai phạm

Đây là điển hình của trường hợp xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định vì doanh nghiệp không tuân thủ quy trình và cố tình “né thuế”.

4.2. Doanh nghiệp B quên nộp hồ sơ tiếp tục hoạt động

Doanh nghiệp B tại TP.HCM tạm ngừng hoạt động đến hết tháng 03/2025. Ngày 01/04 doanh nghiệp bắt đầu ký hợp đồng lại, phát hành hóa đơn, chuyển tiền,… nhưng không nộp hồ sơ tiếp tục hoạt động với Sở KH&ĐT.

Hệ thống thuế ghi nhận trạng thái “Tạm ngừng”, do đó doanh nghiệp bị cưỡng chế mã số thuế khi đăng ký phát hành hóa đơn điện tử tháng 4.

Kết quả xử phạt:

• Phạt 7 triệu đồng do không thông báo tiếp tục hoạt động đúng quy định
• Buộc điều chỉnh lại toàn bộ hóa đơn đã phát hành sau ngày 01/04

Bài học: Tưởng như chỉ là một sơ suất nhỏ về thủ tục hành chính, nhưng lại khiến doanh nghiệp bị đình trệ hoạt động, mất khách hàng và thiệt hại tài chính đáng kể.

5. Cách khắc phục và phòng tránh rủi ro xử phạt thuế

5.1. Nộp lại thông báo – bổ sung hồ sơ theo mẫu

Trong trường hợp doanh nghiệp đã để xảy ra vi phạm liên quan đến tạm ngừng sai quy định, điều quan trọng đầu tiên là khẩn trương nộp lại hồ sơ hợp lệ. Nếu chưa thông báo tạm ngừng hoặc tiếp tục hoạt động đúng hạn, cần nộp bù theo Mẫu II-21 hoặc mẫu tương ứng với hộ kinh doanh.

Trường hợp đã phát sinh giao dịch, doanh nghiệp nên lập biên bản giải trình và phối hợp với cơ quan thuế để điều chỉnh hồ sơ, kê khai bổ sung. Việc chủ động sửa sai là yếu tố quan trọng giúp giảm nhẹ mức xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định.

5.2. Tư vấn trước khi tạm ngừng – xác định nghĩa vụ thuế

Trước khi nộp hồ sơ tạm ngừng hoạt động, doanh nghiệp nên được tư vấn bởi đơn vị chuyên môn để:

• Xác định rõ nghĩa vụ thuế còn tồn đọng
• Lập kế hoạch kê khai đúng hạn (kể cả khai trắng)
• Khóa hóa đơn, tài khoản ngân hàng đúng thời điểm

Việc chuẩn bị tốt ngay từ đầu sẽ giúp doanh nghiệp tránh được toàn bộ chuỗi sai sót có thể dẫn đến bị xử phạt về thuế sau này.

5.3. Sử dụng dịch vụ đại diện thuế – giảm rủi ro

Thực tế cho thấy, hơn 80% các trường hợp bị xử phạt thuế vì tạm ngừng sai là do thiếu người theo dõi nghĩa vụ thuế trong thời gian tạm ngừng. Do đó, việc sử dụng dịch vụ đại diện thuế, kế toán thuê ngoài là một giải pháp an toàn, tiết kiệm và hiệu quả.

Đơn vị đại diện sẽ thay mặt doanh nghiệp:

• Kiểm tra hồ sơ khai báo trước và sau tạm ngừng
• Khai thuế đúng kỳ (kể cả tạm ngừng)
• Làm việc với Chi cục thuế nếu phát sinh xử lý vi phạm

Giải pháp này phù hợp với các doanh nghiệp nhỏ, hộ kinh doanh không có bộ phận kế toán riêng nhưng vẫn muốn tuân thủ pháp luật đầy đủ, tránh rủi ro bị xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định.

Xem thêm: 6 điều cần lưu ý khi tạm ngừng kinh doanh

6. Dịch vụ hỗ trợ của Gia Minh – tránh sai sót và phạt thuế

6.1. Soát lỗi vi phạm – kê khai lại

Công ty TNHH TM-DV Pháp Lý Gia Minh hỗ trợ doanh nghiệp rà soát toàn bộ hồ sơ thuế liên quan đến tạm ngừng và hoạt động lại, bao gồm:

• Kiểm tra lịch sử tờ khai thuế đã nộp trong thời gian ngừng
• Đối chiếu phát hành hóa đơn, giao dịch ngân hàng
• Kê khai bổ sung – giải trình với cơ quan thuế nếu cần

Quy trình được thực hiện bài bản, đảm bảo đúng quy định theo Nghị định 125/2020/NĐ-CP và các văn bản hướng dẫn mới nhất.

6.2. Tư vấn miễn phí – đại diện làm việc với cơ quan thuế

Không chỉ hỗ trợ kỹ thuật, Gia Minh còn đại diện doanh nghiệp làm việc trực tiếp với cơ quan thuế trong các tình huống như:

• Giải trình vi phạm hành chính về thuế do tạm ngừng sai
• Xin giảm nhẹ mức phạt khi có tình tiết chủ động khắc phục
• Hướng dẫn thủ tục nộp hồ sơ tiếp tục kinh doanh hợp lệ

Đội ngũ Gia Minh có kinh nghiệm thực chiến tại nhiều Chi cục Thuế, đảm bảo hồ sơ được xử lý suôn sẻ, đúng trình tự.

6.3. Cập nhật thay đổi pháp lý 2025 – đồng hành toàn diện

Với các thay đổi từ Nghị định 91/2022/NĐ-CP, Luật Quản lý thuế 2019 và hệ thống hóa đơn điện tử toàn quốc, Gia Minh liên tục cập nhật quy định mới để hỗ trợ khách hàng chủ động:

• Tránh lỗi kê khai theo mẫu cũ
• Áp dụng đúng thời hạn, mẫu biểu mới theo thông tư
• Chuyển đổi trạng thái hoạt động – ngừng – hoạt động lại đúng quy trình

Chúng tôi không chỉ giúp bạn làm đúng – mà còn làm nhanh, tiết kiệm và bền vững về mặt pháp lý.

7. Câu hỏi thường gặp (FAQ)

8. Kết luận

Xử phạt vi phạm thuế do tạm ngừng sai quy định là rủi ro phổ biến nhưng hoàn toàn có thể phòng tránh nếu doanh nghiệp thực hiện đúng và đủ các nghĩa vụ khai báo – cả trước, trong và sau thời gian tạm ngừng hoạt động.

Việc chủ quan hoặc không hiểu đúng quy trình có thể khiến bạn bị phạt từ vài triệu đến hàng chục triệu đồng, thậm chí bị kiểm tra đột xuất hoặc cưỡng chế mã số thuế. Để tránh điều này, hãy luôn rà soát tình trạng thuế, cập nhật các mẫu biểu mới và phối hợp với cơ quan quản lý đúng thời điểm.

Nếu bạn cần hỗ trợ soạn hồ sơ, rà soát lại quá trình tạm ngừng – hoạt động – kê khai thuế hoặc làm lại toàn bộ thủ tục một cách hợp pháp, Công ty TNHH TM-DV Pháp Lý Gia Minh chính là đơn vị tư vấn đáng tin cậy để đồng hành cùng bạn.

☎ Hotline tư vấn miễn phí: 0932.785.561 – 0939.456.569
🌐 Website: giayphepgm.com